قنبری, زهرا and فرخ نیا, مریم and نبی پور, ایرج (2013) مدلسازي مولکولي برهمکنش نورزوآنتامين و همولوگ هاي آن با آنزيم کلاژناز1 انساني و شبيه سازي اين برهمكنش ها جهت يافتن جزئيات مكانيسم اثر نورزوآنتامين. Other thesis, دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی بوشهر.
|
Text
ghanbari1.pdf Download (5MB) | Preview |
Abstract
زمینه: آلکالوئیدهای Zoanthamine که اولین بار بیش از 20 سال پیش استخراج شدند، ترکیباتی ویژه و جالب برای دانشمندان دریایی هستند؛ زیرا دارای چارچوب ساختاری جدید و طیف گسترده ای از فعالیت های بیولوژیکی هستند. Norzoanthamine که از مرجان دریایی Zoanthus sp جدا شده است، نشان داده است که فعالیت آنتی استئوپروتیک در موش هایی که تخمدان آنها برداشته شده است (مدل یائسگی) دارد. به عنوان یک نتیجه از فعالیت های آن در حفظ کلاژن، نورزوآنتامین به عنوان یک داروی امیدبخش برای پیشگیری و درمان استئوپروز همرا با از دست رفتن تراکم استخوان، در نظر گرفته شده است. مواد و روش کار: در این مطالعه، مهار MMP-1 فرض شده است که موجب تغییر وضع استخوان در شرایط پاتولوژیکی می شود. با استفاده از داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی، اثرات مهاری نورزوآنتامین و 10 همولوگ آن ارزیابی شد. شبیه سازی دینامیک مولکولی 10 کمپلکس مهارکننده-پروتئین بر اساس ساختارهای اولیه به دست آمده از داکینگ مولکولی، برای یافتن جهت گیری مناسب لیگاند در سایت فعال MMP-1 انجام شده است. ثبات شبیه سازی با استفاده از پارامترهای مختلف ثبات بررسی شده است. سپس انرژي آزاد برهمكنش ميان ليگاند و پروتئين با استفاده از الگوريتم MM-PB/GBSA برای آشکار شدن قدرت اتصال لیگاند، انجام شده است. یافته ها: نتایج ما، موافق با شواهد تجربی می باشد و نشان می دهد که آلکالوئیدهای Zoanthamine می توانند به عنوان مهارکننده قوی MMP-1 عمل کنند. دو مولکول به عنوان کاندیداهای قوی بر اساس فعل و انفعال با ریشه های سایت فعال MMP-1 انتخاب شده اند. نتیجه گیری کلی: در نهایت، استفاده مؤثر از مهارکننده های MMP-1 با منشأ دریایی، یک شروع امیدبخش در کنترل بیماری های بسیاری مانند استئوپروز، بیماری های خودایمنی و سرطان است. واژگان کلیدی: آلکالوئیدهای Zoanthamine، استئوپروز، مهارکننده های MMP-1، داکینگ مولکولی، دینامیک مولکولی
| Item Type: | Thesis (Other) |
|---|---|
| Subjects: | R Medicine > R Medicine (General) |
| Divisions: | Faculty of Medicin |
| Depositing User: | آنیتا اسلامی |
| Date Deposited: | 09 Sep 2014 08:34 |
| Last Modified: | 09 Sep 2014 08:34 |
| URI: | http://eprints.bpums.ac.ir/id/eprint/976 |
Actions (login required)
 |
View Item |
